外文數(shù)據(jù)庫PUBMED檢索.ppt

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1、外文數(shù)據(jù)庫 PUBMED檢索 PubMed數(shù)據(jù)庫 PubMed簡介 PubMed的檢索規(guī)則 PubMed的檢索方法 PubMed全文獲取方式 一、 PubMed簡介 網(wǎng)址: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pu bmed/ 或 www.pubmed.gov(com; org; net) 世界最具權(quán)威性的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù) 庫,由 NLM (美國國立醫(yī)學(xué)圖書 館) NCBI (美國國家生物技術(shù) 信息中心)向因特網(wǎng)用戶提供 免 費(fèi) 文獻(xiàn)檢索服務(wù) (自 1997-6-26起 ) 收錄 70余個(gè)國家 5400多種生物醫(yī)學(xué) 期刊的題錄與文摘

2、,其中收錄中文 刊 100余種,是世界上最權(quán)威的醫(yī) 學(xué)數(shù)據(jù)庫。 現(xiàn)有 1950年以來的 2200多萬篇文獻(xiàn) 的記錄 (其中 MEDLINE記錄 1700多 萬條 ) 目前每年增加 60余萬條文獻(xiàn)記錄 記錄中 90%的文獻(xiàn)為英文。 PubMed簡介 MEDLINE Indexed 1966 to prensent的 MEDLINE已標(biāo)引數(shù)據(jù), 有 MeSH字段和摘要,每條記錄標(biāo)有: PubMed-indexed for MEDLINE OldMEDLINE 1949-1965年間的 MEDLINE數(shù)據(jù),無 MeSH 字段和摘要,每條記錄標(biāo)有: PubMed- OLDMEDLI

3、NE for Pre1966 PubMed收錄數(shù)據(jù) MEDLINE Inprocess 最新的 MEDLINE處理中數(shù)據(jù),未標(biāo)引,無 MeSH字段。每條記錄標(biāo)有: PubMed-in process。 Publisher-Supplied 出版商提供的電子文獻(xiàn)題錄,每條記錄標(biāo)有 : PubMed-as supplied by publisher,分 為兩類: MEDLINE 收錄,逐步轉(zhuǎn)為 In Process, Indexed狀態(tài)。 Not MEDLINE: PubMed 收錄, MEDLINE 不收錄,一直標(biāo)注 PubMed-as supplied by publishe

4、r或 PubMed PubMed收錄數(shù)據(jù) PubMed數(shù)據(jù)類型(狀態(tài)) PubMed除了 1966年以前的 OldMedline,其余文獻(xiàn)按處理過程 分 4種類型(或狀態(tài)) PubMed - as supplied by publisher PubMed - in process PubMed PubMed - indexed for MEDLINE 屬于 Medline收錄范圍,建立 ti、 au、 ab等基本書目信息。 (暫)不屬于Medline收錄范圍, 但也建立 ti、 au、 ab 等基本書目信息。 賦予 MeSH、 PT等字段并被 index。 PubMed主頁

5、初識(shí) PubMed 使用幫助 常用工具 更多服務(wù) 檢索詞輸入框 標(biāo)題 作者 出處 處理狀態(tài) 非英文的文獻(xiàn) 篇名上有中括 號(hào) 且注明 有語種 英文文獻(xiàn) 土耳其語 篇名 布爾邏輯運(yùn)算 截詞檢索 強(qiáng)制檢索 字段檢索 二、 PUBMED的檢索規(guī)則 可輸入 單詞 、 詞組 或 句子 進(jìn)行 檢索 可用的邏輯運(yùn)算符: AND、 NOT、 OR(必須大寫) 布爾邏輯運(yùn)算順序是從左至右, 圓括號(hào)優(yōu)先 布爾邏輯運(yùn)算 截詞檢索 可使用截詞符 *,擴(kuò)大檢索范圍,提高查全 率。 Vaccina Vaccine Vaccines Vacci

6、nation vaccinated Vaccin* 截詞檢索可以 擴(kuò)大檢索范圍 提高查全率。 Vaccin*ti 強(qiáng)制檢索 詞組強(qiáng)制檢索 (精確檢索 )用雙引號(hào), 例: “single cell,系統(tǒng) 會(huì)將其作為一個(gè)不可分割的詞組在 數(shù)據(jù)庫的全部字段中進(jìn)行檢索。 詞組強(qiáng)制和截詞檢索時(shí),系統(tǒng)的智 能詞語匹配功能將不再被執(zhí)行。例 如: liver cancer將不映射到 MeSH 詞 Liver Neoplasms 強(qiáng)制檢索 普通檢索 single cell single cell 字段限定檢索 可在檢索詞后加 字段名 ,進(jìn)行限 定字段檢索。如:查找

7、作者為 crick在 1993年發(fā)表的有關(guān) DNA方 面的文獻(xiàn) . 檢索式: DNAmh AND crickau AND 1993dp 字段限制檢索 其規(guī)則是:檢 索詞 +字段 標(biāo)識(shí) DNAmh AND crickau AND 1993dp 縮寫 全稱 縮寫 全稱 AB Abstract LA Language AD Affiliation(機(jī)構(gòu)) MH MeSH Terms AU Author(作者) PT Publication Type DP Publication Date SO Source CP Publication country TA Journal

8、Title(刊名) TI Title TI Title(篇名) IS ISSN TW Text Words 常用字段 ( 檢索時(shí)大小寫都可以 ) 三、 PUBMED的檢索 方法 基本檢索 主題檢索 高級(jí)檢索 (一)基本檢索 檢索某主題的文獻(xiàn) 檢索某一作者發(fā)表的文獻(xiàn) 檢索發(fā)表在某期刊上的文獻(xiàn) ...... 在檢索框中鍵入一個(gè)或多個(gè)英文單 詞 ( 大寫或小寫均可 ) , 點(diǎn)擊 GO按 鈕 。 PubMed系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在 主題詞表 , 期刊刊名表 , 著者全稱表 及 著者索 引 中查詢與輸入的詞相匹配的形式 , 這就是它特有的 “ 自動(dòng)詞匯匹配功 能 ” 。

9、1.某一主題的檢索 檢索有關(guān)腫瘤 (cancer)的文獻(xiàn) cancer neoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAll Fields 書寫規(guī)則: 姓前名后 ,姓用全稱,名縮寫。 考慮到作者姓名的不同形式, PubMed采用自 動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行作者姓名檢索,如: smith j將 檢索成 smith ja,smith jb,smith jr 等。 精確檢索:可以用雙引號(hào)將作者名引起來, 再加作者字段限定 AU,如: smith jau, 實(shí)現(xiàn)精確查找。 2.檢索某一作者發(fā)表的文獻(xiàn) 作者姓名檢索 按照

10、姓 (全寫 ) +名 (縮寫 ), 之間不用標(biāo)點(diǎn) 鍵入作者姓名 smith j 精確檢索避免 PubMed自動(dòng) 詞匯轉(zhuǎn)換。 smith jau 規(guī)則:全稱或 ISSN號(hào)或 MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫 , ta 如:檢索 細(xì)胞生物分子 期刊,在檢索框中鍵入期刊 名, molecular biology of the cell,系統(tǒng)會(huì)將它轉(zhuǎn)換成 mol biol celljournal進(jìn)行檢索?;蛑苯虞斎?Medline的 期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式( mol biol cell),輸入刊物的 ISSN: 1059-1524。 如果一個(gè)雜志名恰好是主題詞或關(guān)鍵詞,如: c

11、ancer, science, cell等, PubMed會(huì)首先將這些詞轉(zhuǎn)換成 MeSH詞表 中的主題詞進(jìn)行檢索。因此,需要將檢索請(qǐng)求進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化 處理,即在雜志名后面加 TA。如:“ cell”ta 3.檢索某一期刊上的文獻(xiàn) mol biol cell 期刊的一般檢 索,是在檢索 輸入框中鍵入 期刊名或期刊 的 ISSN號(hào) 期刊的標(biāo)準(zhǔn)檢 索,是在期刊 名后面加字段 限定 TA. 比 如 :cellta cellta Filter是一個(gè)條件限定,可以進(jìn)行年齡組、 性別、人或動(dòng)物、出版類型、時(shí)間、語言等 方面的選擇,將檢索的文獻(xiàn)限定在一定范圍 內(nèi)。 4. Filte

12、r 限定檢索 文獻(xiàn)年限 文獻(xiàn)可獲取性 文獻(xiàn)類型 研究對(duì)象類 型 清除 我不記得字段 我想看看之 前的操作 有高級(jí)檢索呢 (二)高級(jí)檢索( advanced search) 字段選擇 檢索歷史 1、點(diǎn)擊主頁右下角的 MeSH Database進(jìn)入主題詞檢索界面; 2、輸入檢索詞后,點(diǎn)擊 go按鈕,系統(tǒng)將顯示與該詞有關(guān)主 題詞; 3、點(diǎn)擊該主題詞進(jìn)一步顯示該主題詞的定義、樹狀結(jié)構(gòu)、 組配的副主題詞; 4、選擇合適的主題詞與副主題詞后,點(diǎn)擊 send to按鈕, 進(jìn)入檢索表達(dá)式瀏覽窗口; 5、點(diǎn)擊 Search PubMed將顯示檢索結(jié)果。 (三)主題檢索(

13、 Mesh Database) 主題詞 MeSH檢索 主題詞數(shù)據(jù)庫 在 PubMed首 頁導(dǎo)航欄的右 下角 主題詞數(shù)據(jù)庫 主題詞 MeSH檢索 輸入普通詞 查找對(duì)應(yīng)主題詞 主題詞 MeSH檢索 一般一個(gè)主題 詞還要配合一 個(gè)副主題詞進(jìn) 行組合檢索 選擇副主題詞 選中副主題詞 添加到檢索框中, 查看檢索式,檢索 比較 主題詞檢索舉例 1、 檢索腎衰竭( Kidney Failure )治療 ( therapy)方面的文獻(xiàn)。 2、缺血性心臟病( ischemic heart disease ) 引起心力衰竭( heart failure) 老年人 方面的帶文

14、摘的文獻(xiàn)。 通過 PubMed檢索出來的文獻(xiàn),部分通過瀏 覽摘要即可,有的還需要查看全文,以作進(jìn)一步 的研究,全文的獲取方法主要有: 一: 免費(fèi)的全文 四、 PUBMED全文獲取 PubMed收錄 的文獻(xiàn)大約有 5%是免費(fèi)的 可以直接打開 全文 免費(fèi)全文 點(diǎn)擊打開全文 PubMed全文獲取 打開 PDF全文 免費(fèi)的全文并 不代表學(xué)術(shù)價(jià) 值低,大部分 的生命科學(xué)的 全文都是免費(fèi) 的 二: 學(xué)校已訂購的全文 如果需要的文獻(xiàn),學(xué)校已訂購了該文獻(xiàn)所在 的全文數(shù)據(jù)庫,可以直接打開或到相應(yīng)的全文數(shù) 據(jù)庫中查找。 學(xué)校 已訂購 SpringerLink 和 EBSCO等外 文全文庫,一 般學(xué)校也有訂 購 學(xué)校 已訂購 學(xué)校未訂購的 全文,如果不 是免費(fèi)的,一 般需要付費(fèi) 學(xué)校未 訂購 三: 濟(jì)南泉方 PubMed文獻(xiàn)服務(wù)系統(tǒng) 沒有免費(fèi)的全文以及學(xué)校未訂購的全文,一 般需要付費(fèi)才可以看到,這類文獻(xiàn)可以通過基 于館際互借的濟(jì)南泉方 PubMed文獻(xiàn)服務(wù)系統(tǒng) 來獲取 (),但需要 郵箱綁定。

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